日立ソフト（執行役社長：小野 功、本社：東京都品川区）は、バイオ実験データ内のDNA繰り返し配列（注１）を識別するソフトウェア「AutoTyper」をバイオインフォマティクスソリューション「DNASIS®」シリーズの新しい製品として開発しました。「DNASIS® AutoTyper」は、今まで研究者により手作業で行われていたDNA繰り返し配列の識別を、自動的に高精度で行う画期的なソフトウェアです。
医学分野での重要な研究テーマの一つに、ヒトの疾患遺伝子の研究が挙げられます。この研究では、健康な人と患者のDNA繰り返し配列を比較し、両者の違いを調査します。調査結果である実験データにはノイズが混入しており、この中から正しいデータのみを識別するには、高度な知識と経験を持つ研究者による煩雑な手作業が必要になります。日立ソフトは、従来手作業に頼っていたデータの識別を、データマイニング技術にもとづいて自動化することに成功しました。「DNASIS® AutoTyper」は、ヒトの疾患遺伝子の研究だけでなく、食の安全・安心を支援するための農畜産物の鑑定・品種改良など、様々な産業分野で活用することができます。日立ソフトは、「DNASIS® AutoTyper」を組み込んでDNA繰り返し配列の解析に最適化したシステムを提供いたします。
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「DNASIS® AutoTyper」の特長
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DNA繰り返し配列の識別作業にかかる手間・時間・コストを大幅に削減することができます。
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利用者の知識と経験の度合いにかかわらず正確かつ均質な識別結果を得ることができます。
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「DNASISR AutoTyper」を適用できる研究分野と波及効果
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生活習慣病等の疾患や肥満等の体質に関与する遺伝子の研究や、DNAを用いた診断による健康増進
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細菌・ウイルス等と、それらによる感染症に関する研究の迅速化と低コスト化
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産地偽装防止を目的とした、農畜産物・海産物等の鑑定による食の安全の確保
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農畜産物・海産物等の品種改良による食料の安定供給
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法医学分野における個体識別の迅速化と識別結果の均質化など。
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「DNASISR AutoTyper」開発プロジェクト
「DNASISR AutoTyper」で使われている、DNA繰り返し配列を自動識別する手法は、社団法人 バイオ産業情報化コンソーシアム（注２）（以下JBIC）と日立ソフトが2000年から2006年まで実施した「遺伝子多様性モデル解析事業」（注３）を元に開発されたものです。 JBICによるリウマチ関連遺伝子の研究において、「DNASISR AutoTyper」の原型となった計算手法を用いた結果、DNA繰り返し配列の一種であるマイクロサテライトDNAのうち平均94%を識別することができました（注４）。また、識別に要する時間は、手作業で行った場合と比較して最大約50%まで短縮することができました。この成果を元に、日立ソフトは高度な知識と経験を用いて、計算手法の機能を強化して製品化を行いました。
＜稼動環境＞
「DNASIS® AutoTyper」は、Windows XP又はWindows Vista上にて稼動します。
＜概念図＞
- (注1)
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DNA繰り返し配列：決まった塩基配列がDNA内で連なっている部分を指し、DNA鑑定等で使われています。
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社団法人 バイオ産業情報化コンソーシアム：
会 長：平田 正（協和発酵工業株式会社 相談役）
所在地：〒135-8073 東京都江東区青海2-45 TIME24ビル10階
設 立：1998年 11月 任意団体JBIC設立
2000年 7月 社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム（JBIC）設立
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遺伝子多様性モデル解析事業：2000年から2006年まで実施された事業であり、糖尿病・がんなどをモデル疾患として、日本人を対象に遺伝子型判定を実施。得られた情報からモデル疾患関連情報データベースの構築と、遺伝統計学的解析ソフトウェアの整備を行いました。
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参考文献：Novel algorithm for automated genotyping of microsatellites: Nucleic Acids Research, 2004, Vol.32, No.20, pp. 6069-77
■本件に関するお問合せ先
担当部署：＠Sales24
ホームページ http://sales24.hitachisoft.jp/
Tel: 03-5479-8831
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Windows及びWindows Vistaは、米国 Microsoft Corporationの登録商標です。
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DNASISは日立ソフトの登録商標です。
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AutoTyperは日立ソフトの商標です。
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日立ソフトの正式名称は、日立ソフトウェアエンジニアリング株式会社です。
